明朝弘治年间，从溧水县分出置高淳县，县治为淳溪镇，属南直隶应天府。县因高淳古镇而得名。高淳镇即今淳溪镇。清朝初年，改明应天府为江宁府，高淳属之。太平天国定都天京期间，高淳县属天京省江宁郡。同治三年（1864年），清军攻陷天京，高淳复属江宁府。
民国元年(1912)，废府，高淳县隶江苏省。1914年，于省、县两级间设道，高淳属江苏省金陵道。1927年，废道，县隶于江苏省。1934年，江苏省实行行政区督察制，高淳县属溧阳行政督察区。1935年9月，改属第十行政督察区(驻江宁)。1937年12月7日，侵华日军陷高淳县城，建立伪政权；民国高淳县政府撤至第五区青桂塘，受江南行署第一区行政督察专员公署管辖。
1949年4月23日，中国人民解放军第35军攻占南京城。同日，中共高淳县地下特别支部在高淳县城张贴标语，散发传单，组织地方商人成立高淳县地方秩序维持委员会，稳定高淳当地局势。5月2日，中共高淳县委、高淳县人民政府地方干部和一个武装排进驻县城。当晚，县委、县政府接收中华民国高淳县政府秘书叶骏麒等交出的印鉴、档案、物资清册，以及县警察局警-察的q支。行政上，高淳县属于苏南行署区镇江地区专员公署领导。3日，宣布正式成立高淳县人民政府。高淳县委重新分配高淳地下特别支部和宣高区委成员的工作。4日，县委、县人民政府接管中华民国高淳县政府各科室、国民党县党部、参议会、警察局、司法处等党政部门的档案、印章、粮食、物资等[。
1953年1月，撤销苏南行署区，成立江苏省，高淳县从南京划出，属江苏省镇江专区；1958年改为常州专区，高淳属之。1959年，又改为镇江专区，高淳县属镇江专区。1983年3月1日，实行市管县体制，高淳县重新划回南京市管辖。2013年，高淳撤县设区。
关于高淳地方资料书目如下：
高淳史志资料 第1辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079455
高淳史志资料 第5辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079459
高淳史志资料 第6辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079460
民国高淳县志_刘春堂修；吴寿宽纂_10818341
明清道教神像画_高淳县文化局编_11734720
宣统高淳县郷土志 民国高淳县志 1_（清末民国）吴寿宽编；（清末民国）刘春堂修；（清末民国）吴寿宽纂_13483615
民国高淳县志 2_（清末民国）刘春堂修；（清末民国）吴寿宽纂_13483616
中共高淳县地方史 1949-2006_中共高淳县委党史工作办公室编著_13527517
高淳史志资料 第2辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079456
高淳文史资料 第15辑 高淳文物_高淳县政协学习、文史委员会，高淳县文化局编_11374705
壮心不已的周超_新华日报社政治处，中共高淳县委宣传部编_13133124
1980年高考政治复习参考资料_高淳县文教局教研室编_13226959
乾隆高淳县志 2_（清）朱绍文修；（清）盛业纂_13483614
民国高淳县志 3_（清末民国）刘春堂修；（清末民国）吴寿宽纂_13483617
高淳史志资料 第3辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079457
高淳史志资料 第9辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079463
高淳县志_薛兴祥主编；高淳县地方志编纂委员会编纂_10301279
高淳文史资料 第13辑_中国人民政治协商会议江苏省高淳县委员会文史资料委员会编_11374704
高淳文史资料 第16辑_高淳县政协宣教文卫委员会编_11374707
高淳史志资料 第4辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079458
乾隆高淳县志 1_（清）朱绍文修；（清）盛业纂_13483613
乾隆高淳县志 2_（清）朱绍文修；（清）盛业纂_13483614
连接高铁和机场的城际轨道 南京至高淳城际轨道南京南站至禄口机场段工程设计总结_广州地铁设计研究院有限公司，南京地铁建设有限责任公司编著_13901513
中国地方志集成 善本方志辑 第1编 46 乾隆武进县志 2 乾隆高淳县志 乾隆溧水县志 1_凤凰出版社编_14349260
中国地方志集成 江苏府县志辑 34 民国高淳县志 乾隆句容县志_凤凰出版社编_12833528
江苏省高淳县地名录 内部资料_高淳县地名委员会编_13114373
民国高淳县志 2_（清末民国）刘春堂修；（清末民国）吴寿宽纂_13483616
高淳史志资料 第10辑 纪念政协高淳县委员会成立十周年专辑_中国人民政治协商会议江苏省高淳县委员会文史资料委员会_10079464
高淳土菜_马永山执行编纂_12373801
高淳陶瓷公司志_中共高淳县委党史工作办公室，高淳县地方志办公室编_12944357
乾隆高淳县志 1_（清）朱绍文修；（清）盛业纂_13483613
中共高淳县地方史 1949-2006_中共高淳县委党史工作办公室编著_13527517
高淳史志资料 第8辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079462
天一阁藏明代方志选刊 嘉靖高淳县志 江苏省__10485465
高淳文史资料 第12辑 高淳谚语与歇后语_中国人民政治协商会议江苏省高淳县委员会文史资料委员会编_11374703
高淳县志 1986-2005 上_高淳县地方志编纂委员会_13708042
高淳县志 宿迁县志_故宫博物院编_12292159
高淳县志 1986-2005 下_高淳县地方志编纂委员会_13708043
民国高淳县志 3_（清末民国）刘春堂修；（清末民国）吴寿宽纂_13483617
高淳史志资料 第7辑_中共高淳县委党史资料征集小组办公室高淳县志编纂委员会办公室等_10079461
高淳文史资料 第17辑 高淳地名故事_陈后翔撰；高淳县政协宣教文卫委员会编_11374671
江苏高淳目连戏两头红台本_茆耕茹校订_12140229
宣统高淳县郷土志 民国高淳县志 1_（清末民国）吴寿宽编；（清末民国）刘春堂
光绪高淳县志二十八卷首一卷（清）楊福鼎修 （清）陳嘉謀纂 清光緒七年（1881
